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技術文章

Thermo賽默飛7500實時熒光定量PCR系統正確操作方法

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賽默飛世爾科技 Applied Biosystems 7500 實時熒光定量PCR系統的標準、安全操作流程。賽默飛世爾科技 Applied Biosystems 7500 實時熒光定量PCR系統的標準、安全操作流程。操作必須由經過培訓的人員在符合生物安全規定的實驗室中進行。不同版本的軟件界面可能略有差異,但核心步驟一致。


賽默飛7500實時熒光定量PCR系統標準操作流程


一、開始階段:實驗前準備

1、儀器準備

(1)開機: 依次打開電腦主機、顯示器,然后打開7500儀器主機電源(通常在儀器背面)。

(2)啟動軟件: 雙擊桌面上的 “7500 System Software" 圖標啟動軟件。軟件將自動進行自檢和初始化,此過程約需10-15分鐘。請等待初始化完成,直至主界面就緒。

(3)檢查耗材: 確認有足夠的一次性 MicroAmp® Optical 96-Well或8-Strip Reaction Plates(反應板)和 Optical Adhesive Covers(光學封膜)。


2、實驗設計

(1)創建實驗文件: 在軟件主界面,選擇 “Create New Experiment" 或 “File -> New"。

(2)選擇實驗類型: 在實驗設置向導中,選擇 “Quantitation (Standard Curve)"(標準曲線定量)、“Comparative Ct (ΔΔCt)"(相對定量)或其他適合您實驗的類型。

(3)設置探針/染料: 在 “Detectors" 或 “Dye Manager" 中,添加您實驗中使用的熒光染料(如 FAM, VIC)或探針。為每個檢測目標指定名稱和報告基團/淬滅基團類型。

(4)設置反應體系: 指定反應體積(通常為20-50 μL)。

3、配制PCR反應體系

(1)在冰上或超凈工作臺中操作: 確保所有試劑解凍并短暫離心。

(2)配制預混液: 根據實驗設計,按比例混合除模板DNA外的所有試劑(如Master Mix、引物、探針、水)。建議配制一定冗余(例如,多配10%的量)以補償加樣誤差。

(3)分裝: 將預混液分裝到PCR反應板或八連管中。

(4)加入模板: 最后加入模板DNA,并輕輕混勻(避免產生氣泡)。強烈建議設置復孔(至少3個技術重復)以及陰性對照(No Template Control, NTC)和陽性對照。

(5)封膜: 使用光學封膜密封反應板,確保封膜平整、無褶皺、無氣泡。然后用壓膜器或滾輪用力壓實邊緣。

4、上樣

(1)清潔樣品槽: 用無水乙醇和無塵紙輕輕擦拭7500儀器的樣品槽基座,去除任何灰塵或污染物。

(2)放置反應板: 將封好膜的反應板放入樣品槽中,確保反應板的左上角(A1孔)對準樣品槽的左上角標記。輕輕向下按壓四角,確保板子放置平穩。


二、第二階段:上機運行

1、創建運行方法

(1)設置反應板布局: 在軟件界面,點擊 “Plate Setup" 選項卡。通過拖放或雙擊,為每個孔指定其樣品名稱、任務類型(未知樣品、標準品、陰性對照等)和對應的檢測探針(Detector)。

(2)編輯運行程序:

點擊 “Instrument" 選項卡。

Stage 1 (升溫階段): 通常為 50°C for 2 minutes(UDG酶防污染孵育,如果試劑包含此成分)。

Stage 2 (預變性): 通常為 95°C for 10-20 minutes(熱啟動酶活化)。

Stage 3 (PCR循環): 設置40-50個循環,包括:

(3)變性: 95°C for 15 seconds。

退火/延伸: 60°C for 1 minute。在此步驟采集熒光信號。軟件通常會自動設置為在60°C階段采集信號。

(可選)溶解曲線階段: 如果使用SYBR Green染料,需添加溶解曲線步驟。

2、開始運行

(1)保存方法: 保存您的實驗文件和運行方法。

(2)啟動運行: 點擊工具欄上的 “Start Run" 按鈕。

(3)確認運行參數: 在彈出的對話框中,再次確認反應板位置、運行方法文件名和樣品文件名無誤。

(4)開始運行: 點擊 “OK",儀器將開始運行。運行過程中,您可以實時查看擴增曲線和熒光信號的變化。


三、第三階段:數據分析與關機

1、數據分析

(1)運行結束后,軟件會自動保存數據。

(2)設置基線閾值(Threshold)和基線(Baseline): 這是數據分析的關鍵步驟。

軟件通常會自動設置,但手動調整可能使結果更準確。

閾值(Threshold): 設置在指數擴增期的線性范圍內,通常為熒光信號剛進入指數增長階段的水平。所有樣本的閾值線應保持一致。

基線(Baseline): 設置為背景熒光信號平穩的循環數范圍(通常是前3-15個循環)。

(3)查看結果: 軟件會自動給出每個樣品的Ct值。您可以在 “Results" 頁面查看擴增曲線、標準曲線(如果做了)、熔解曲線(如果做了)以及最終的定量結果。

2、關機

(1)取出反應板: 運行結束后,打開儀器蓋子,小心取出反應板。注意:反應板可能很燙,請佩戴防燙手套。

(2)處理廢液: 根據您實驗室的生物安全規定,將反應板作為生物有害廢物妥善處理。

(3)清潔樣品槽: 再次用無水乙醇和無塵紙清潔樣品槽。

(4)關閉軟件: 在電腦上退出7500系統軟件。

(5)關閉儀器: 先關閉7500儀器主機電源,然后再關閉電腦。


遵循以上標準操作流程,并結合您具體的實驗方案和試劑說明書進行優化,將能確保您獲得可靠、準確的實時熒光定量PCR結果。如有任何不確定之處,請務必咨詢經驗豐富的同事或賽默飛的技術支持。

TEL:18016231680

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