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實時熒光定量PCR（quantitative PCR, qPCR）通過對PCR擴增反應中的每一個循環產物熒光信號的實時監測，實現對起始模板的定性及定量分析。目前主要通過熒光染料或者熒光標記的探針對PCR產物進行標記跟蹤，實時在線監控反應過程，并結合相應的軟件對產物進行分析，計算待測樣品模板的初始濃度。實時熒光定量PCR檢測法在生物學、醫藥學上都有著廣泛的應用。
實時熒光定量PCR檢測法的應用場景和范圍
DNA或RNA的絕對定量分析
包括病原微生物或病毒含量的檢測，轉基因動植物拷貝數的檢測，RNAi 基因失活率的檢測等。
基因表達差異分析
例如比較經過不同處理樣本之間特定基因的表達差異 (如藥物處理、物理處理、化學處理等)，特定基因在不同時相的表達差異以及 cDNA 或差顯結果的確證。基因分型。例如 SNP 檢測，甲基化檢測等。
病原體定量測定
目前，采用熒光定量 PCR 檢測技術可以對淋球菌、沙眼衣原體、解脲支原體、人類乳頭瘤病毒、單純皰疹病毒、肝炎病毒、結核桿菌、細小病毒 B19、EB 病毒和人巨細胞病毒等病原體進行定量測定。與傳統的檢測方法相比具有靈敏度高、取樣少、快速簡便等優點。
藥物研發和療效研究
實時熒光定量 PCR 技術可以快速、準確、定量、靈敏地測定血液或組織中病原體的含量，因此有利用分析藥物的作用效果，為比較不同的配方的療效、用藥量、用藥時間等等提供快速、定量的評價。
實時熒光定量PCR檢測法的應用場景和范圍
DNA或RNA的絕對定量分析
包括病原微生物或病毒含量的檢測，轉基因動植物拷貝數的檢測，RNAi 基因失活率的檢測等。
基因表達差異分析
例如比較經過不同處理樣本之間特定基因的表達差異 (如藥物處理、物理處理、化學處理等)，特定基因在不同時相的表達差異以及 cDNA 或差顯結果的確證。基因分型。例如 SNP 檢測，甲基化檢測等。
病原體定量測定
目前，采用熒光定量 PCR 檢測技術可以對淋球菌、沙眼衣原體、解脲支原體、人類乳頭瘤病毒、單純皰疹病毒、肝炎病毒、結核桿菌、細小病毒 B19、EB 病毒和人巨細胞病毒等病原體進行定量測定。與傳統的檢測方法相比具有靈敏度高、取樣少、快速簡便等優點。
藥物研發和療效研究
實時熒光定量 PCR 技術可以快速、準確、定量、靈敏地測定血液或組織中病原體的含量，因此有利用分析藥物的作用效果，為比較不同的配方的療效、用藥量、用藥時間等等提供快速、定量的評價。
